Les principaux objectifs de la conférence internationale WATMED 3 sont :
Réexaminer et comparer l'état des ressources en eau dans le bassin méditerranéen,
Réconcilier entre la rareté, la qualité et la pérennité de ressources,
Relations entre changements climatiques, sécheresse et désertification,
Réexaminer les méthodes utilisées pour l'évaluation et le suivi de la «santé» des écosystèmes aquatiques Méditerranéens,
Formuler des stratégies et identifier des approches éco-technologiques pour la restauration et la gestion des écosystèmes aquatiques,
Identifier des secteurs de coopération dans les sciences de l'eau entre les pays méditerranéens.